Íme, elérkeztünk a 2006-2007-es felvonáshoz, amely alatt már ez a blog is működött. A sorozat több szempontból is nagy fordulóponthoz érkezett, hiszen az írói stáb nagy része fokozatosan lecserélődött, az epizódok pedig teljesen más hangulatúvá váltak, amelyben csak a vízválasztó volt az új-capricai trauma.
Perceken belül kezdetét veszi a szavazás, addig álljanak itt az ismertetők.
3×01 – Occupation
Az évad premierje eredetileg két különálló epizódnak indult, aztán újravágták egy nagy, kilencven perces változatnak, azonban a DVD-ken és a produkciós számozásban külön-külön jelennek már meg. Négy hónappal vagyunk a cylon megszállás után, Tigh elvesztette a szemét a fogságban, Tyrolék vezetik az ellenállást, Adamáék pedig küszködnek a mentőakció megszervezésével. Az epizód Duck öngyilkos merényletével zárul.
3×02 – Precipice
A folytatás Roslin kihallgatásával és az Új-Capricai Rendőrség rajtaütésével veszi kezdetét. Sharon érkezik a felkelők megsegítésére, ám ezalatt Ellen Tigh-t ráveszi egy Cavil, hogy árulja el a férjét. A premiert Ronald D. Moore írta, a felejthetetlen hangulatért és képsorokért pedig Sergio Mimica-Gezzan a felelős. Az epizódpárosért Emmy-díjra jelölték RDM-et.
3×03 – Exodus, part 1
A fejezetet David Weddle és Bradley Thompson vitte tovább ezzel az akciódúsabb felvonással, amely érdekes módon egy epizódnak indult, de nem fértek bele az időbe. A Centurionokból álló kivégzőosztag szétlövésével nyitunk, majd a történet során az új-capricaiak felkészülnek a kivonulásra, a Pegasus pedig külön utakra indul, míg a Galactica felkészül, hogy kimenekítse az embereket a bolygóról.
3×04 – Exodus, part 2
Ellen Tigh meghal az árulásáért, a támadások elkezdődnek a bolygón, majd a Galactica beugrik a légkörbe, hogy rendet tegyen, aztán majdnem elpusztul a túlerő támadása alatt, csak Han Solo Lee Adama menti meg. Herát és Baltart a cylonok viszik el, Kara még egyszer utoljára megöli Leobent, aztán minden hajó elugrik az Új-Capricáról. A menekülés inkább keresédes, mint győzedelmes ennek a Felix Alcalá által rendezett akcióorgiának a végén.
3×05 – Collaborators
A cylon megszállásról szóló fejezet méltó lezárásaképp a Collaboratorsben Mark Verheiden prezentálja Tom Zarek elnök utolsó rendeletét az árulók kivégzéséről. Michael Rymer első rendezése ez idén, talán a sötét történet, talán a cylonok bázishajójának először történő megjelenítése miatt. Gaetát itt majdnem kiírták a sorozatból, de Verheidennek köszönhetően végül túlélte A Kör tevékenységét.
3×06 – Torn
Egy, a Tizenharmadik törzs által hátrahagyott szonda miatt epidémia fenyegeti a cylonokat, miközben a Galacticán Starbuck és Tigh szítja az ellentéteket a hajón maradtak és az új-capricaiak között. Anne Cofell Saunders írásából Jean de Segonzac rendezett epizódot, először és mindeddig utoljára.
3×07 – A Measure of Salvation
Baltart a hazugságai miatt vallatni kezdi az egyik Hármas, miközben a Galactica megment pár beteg cylont a fertőzött bázishajóról, de mielőtt felhasználhatnák őket egy genocídiumhoz, Helo végez velük, még biztos távolban a letöltőállomástól. A duplarésznek ezt a felét Michael Angeli írta, és a szintén egyalkalmas Bill Eagles rendezte.
3×08 – Hero
David Eick különböző filmekből összeollózótt forgatókönyvét Michael Rymer vitte a képernyőre, így végre megtudjuk, mire utalt Leoben a minisorozatban, amikor Adamának azt mondta, hogy előbb-utóbb eljön az a pillanat, amikor nem rejtőzhet a tettek elől, amiket elkövetett. Ennek a megjegyzésnek egy okos megoldásában fény derül egy sötét foltra az admirális múltjából, Tigh pedig végre összeszedi magát az események hatására.
3×09 – Unfinished Business
Egy flashbackekkel dúsított epizódban visszakacsintunk arra az egy évre, amíg a cylonok nem érkeztek meg az Új-Capricára, és a legénység az azalatt felgyülemlett feszültséget vezeti le egy házi boxbajnokság keretein belül. Michael Taylort Hugo-díjra jelölték a forgatókönyvéért, amelyet Ron Moore is nagyra tart, Robert Young rendezésével egyetemben. A DVD-kiadáson megjelent egy egyórás vágói változat is, mindenkinek az ízlésére van bízva, melyiket választja a szavazáson, ám az tény, hogy a készítők a bővítettet tartják kanonikusnak.
3×10 – The Passage
Ezzel a depresszív epizóddal debütált Jane Espenson, aki azt a hálátlan feladatot kapta, hogy írja ki a sorozatból Louanne "Kat" Katraine-t néhány civil hajóval együtt. A cylonok fedélzetén furcsa fordulatot vesznek az események, miután a D'Anna nevű Hármas ismerkedni próbál az öt utolsó cylonnal két élet között.